Spectral Count: que signifie status « invalid typical » ?

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Spectral Count: que signifie status « invalid typical » ?

Message par ProlineAdmin le Ven 7 Juil - 15:19

Pour une protéine j’ai un statut « invalid typical » que je n’avais jamais vu avant, qu’est-ce que ça signifie ?

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Re: Spectral Count: que signifie status « invalid typical » ?

Message par ProlineAdmin le Ven 7 Juil - 15:24

Ce nouveau statut vient d'une modification faite au niveau du spectral count :

"Spectral Counting quantitation: Allow to calculate SC values in child dataset even for invalid ProteinSet if these ProteinSet are valid in parent dataset."

En détail, cela signifie que si par exemple une protéine
-  a été filtré au niveau d'un dataset fils suite à un filtre: avec 1 peptide spécifique par exemple,
- mais qu'elle apparaît au niveau du dataset de référence : parce qu'elle n'a pas été filtré dans un second fils

alors cette protéine sera présenté dans les 2 dataset fils : dans le premier comme "invalid typical" afin de faire apparaître le fait qu'elle avait été filtré et comme typical (ou sameset/subset selon le cas) dans le second dataset.

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