probleme de taille de la base PostgreSQL

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probleme de taille de la base PostgreSQL

Message par wbienvenut le Lun 19 Juin - 13:34

Bonjour,

un message d'erreur lié à un probable de taille de la base prostgreSQL... Une idée s'il s'agit d'un problème directement lié à Proline ou au systeme de stockage local?

Willy

Error calling Service [proline/dps/msi/ImportResultFiles] : org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: could not extend file "base/7094421/7095576.10": Aucun espace disponible sur le périphérique
 Hint: Check free disk space.
 Where: COPY spectrum, line 1: "1 Spectrum87792 scans:12944, 787.42499 \N 2 false \N \N \N \N \N \N \\x08ac1c5a64e36c40894160e5d0fe6..."
{"code":-32002,"data":"org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.receiveErrorResponse(QueryExecutorImpl.java:2270)\r\norg.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.processCopyResults(QueryExecutorImpl.java:984)\r\norg.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.writeToCopy(QueryExecutorImpl.java:874)\r\norg.postgresql.core.v3.CopyInImpl.writeToCopy(CopyInImpl.java:51)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.impl.PgPeaklistWriter$$anonfun$insertSpectra$1$$anonfun$apply$1.apply(PgPeaklistWriter.scala:96)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.impl.PgPeaklistWriter$$anonfun$insertSpectra$1$$anonfun$apply$1.apply(PgPeaklistWriter.scala:50)\r\nfr.proline.module.parser.mascot.MascotResultFile$$anonfun$eachSpectrum$2.apply(MascotResultFile.scala:640)\r\nfr.proline.module.parser.mascot.MascotResultFile$$anonfun$eachSpectrum$2.apply(MascotResultFile.scala:552)\r\nscala.collection.TraversableLike$WithFilter$$anonfun$foreach$1.apply(TraversableLike.scala:778)\r\nscala.collection.immutable.HashMap$HashMap1.foreach(HashMap.scala:221)\r\nscala.collection.immutable.HashMap$HashTrieMap.foreach(HashMap.scala:428)\r\nscala.collection.immutable.HashMap$HashTrieMap.foreach(HashMap.scala:428)\r\nscala.collection.immutable.HashMap$HashTrieMap.foreach(HashMap.scala:428)\r\nscala.collection.immutable.HashMap$HashTrieMap.foreach(HashMap.scala:428)\r\nscala.collection.TraversableLike$WithFilter.foreach(TraversableLike.scala:777)\r\nfr.proline.module.parser.mascot.MascotResultFile.eachSpectrum(MascotResultFile.scala:552)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.impl.PgPeaklistWriter$$anonfun$insertSpectra$1.apply(PgPeaklistWriter.scala:50)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.impl.PgPeaklistWriter$$anonfun$insertSpectra$1.apply(PgPeaklistWriter.scala:27)\r\nfr.proline.core.dal.BuildJDBCWork$$anon$1.execute(JDBCWorkBuilder.scala:17)\r\nfr.proline.context.DatabaseConnectionContext.doWork(DatabaseConnectionContext.java:466)\r\nfr.proline.core.dal.DoJDBCWork$.withConnection(JDBCWorkBuilder.scala:72)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.impl.PgPeaklistWriter$.insertSpectra(PgPeaklistWriter.scala:27)\r\nfr.proline.core.om.storer.msi.ResultFileStorer$.storeResultFile(ResultFileStorer.scala:71)\r\nfr.proline.core.service.msi.ResultFileImporter.runService(ResultFileImporter.scala:113)\r\nfr.proline.api.service.IService$class.run(IService.scala:44)\r\nfr.proline.core.service.msi.ResultFileImporter.run(ResultFileImporter.scala:30)\r\nfr.proline.cortex.service.dps.msi.AbstractImportResultFiles$$anonfun$doProcess$2.apply(ImportResultFiles.scala:149)\r\nfr.proline.cortex.service.dps.msi.AbstractImportResultFiles$$anonfun$doProcess$2.apply(ImportResultFiles.scala:121)\r\nscala.collection.IndexedSeqOptimized$class.foreach(IndexedSeqOptimized.scala:33)\r\nscala.collection.mutable.ArrayOps$ofRef.foreach(ArrayOps.scala:186)\r\nfr.proline.cortex.service.dps.msi.AbstractImportResultFiles.doProcess(ImportResultFiles.scala:121)\r\nfr.proline.jms.service.api.AbstractRemoteProcessingService.runService(AbstractRemoteProcessingService.scala:32)\r\nfr.proline.jms.ServiceRunner.callService(ServiceRunner.scala:516)\r\nfr.proline.jms.ServiceRunner.handleMessage(ServiceRunner.scala:305)\r\nfr.proline.jms.ServiceRunner.run(ServiceRunner.scala:213)\r\njava.util.concurrent.Executors$RunnableAdapter.call(Unknown Source)\r\njava.util.concurrent.FutureTask.run(Unknown Source)\r\njava.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(Unknown Source)\r\njava.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source)\r\njava.lang.Thread.run(Unknown Source)\r\n","message":"Error calling Service [proline\/dps\/msi\/ImportResultFiles] : org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: could not extend file \"base\/7094421\/7095576.10\": Aucun espace disponible sur le périphérique\n  Hint: Check free disk space.\n  Where: COPY spectrum, line 1: \"1\tSpectrum87792 scans:12944,\t787.42499\t\\N\t2\tfalse\t\\N\t\\N\t\\N\t\\N\t\\N\t\\N\t\\\\x08ac1c5a64e36c40894160e5d0fe6...\""}
at com.thetransactioncompany.jsonrpc2.JSONRPC2Parser.parseJSONRPC2Response(JSONRPC2Parser.java:540)
at com.thetransactioncompany.jsonrpc2.JSONRPC2Parser.parseJSONRPC2Message(JSONRPC2Parser.java:287)
at com.thetransactioncompany.jsonrpc2.JSONRPC2Message.parse(JSONRPC2Message.java:137)
at com.thetransactioncompany.jsonrpc2.JSONRPC2Message.parse(JSONRPC2Message.java:99)
at fr.proline.studio.dpm.task.jms.ImportIdentificationTask.taskDone(ImportIdentificationTask.java:144)
at fr.proline.studio.dpm.task.jms.AbstractJMSTask.onMessage(AbstractJMSTask.java:185)
at org.hornetq.jms.client.JMSMessageListenerWrapper.onMessage(JMSMessageListenerWrapper.java:103)
at org.hornetq.core.client.impl.ClientConsumerImpl.callOnMessage(ClientConsumerImpl.java:1116)
at org.hornetq.core.client.impl.ClientConsumerImpl.access$500(ClientConsumerImpl.java:56)
at org.hornetq.core.client.impl.ClientConsumerImpl$Runner.run(ClientConsumerImpl.java:1251)
at org.hornetq.utils.OrderedExecutorFactory$OrderedExecutor$1.run(OrderedExecutorFactory.java:104)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(Unknown Source)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source)
at java.lang.Thread.run(Unknown Source)

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Re: probleme de taille de la base PostgreSQL

Message par ProlineAdmin le Mar 20 Juin - 8:42

Bonjour,

Je crains que ce soit un problème d'espace disque sur le disque contenant le serveur Postgresql. Tu as accès aux informations d'espace disponible ?

Véronique

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Re: probleme de taille de la base PostgreSQL

Message par wbienvenut le Mar 20 Juin - 10:11

Oui effectivement, on vient de me confirmer qu'il s'agissait d'un problème de notre coté...

wbienvenut

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Re: probleme de taille de la base PostgreSQL

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